XIST

XIST
	; La figura mostra imatges confocals d'un experiment combinat d'ARN-ADN FISH per a Xist en fibroblasts de ratolí femení.
Identificadors
Àlies	XIST (HUGO), DXS1089, DXS399E, LINC00001, NCRNA00001, SXI1, swd66, X inactive specific transcript (non-protein coding), X inactive specific transcript, Xist
Identif. externs	OMIM: 314670 MGI: 98974 GeneCards: XIST OMA: XIST - orthologs
Localització del gen (humà)
	Cromosoma: X (humà)
Fi	73.852.723 bp
Localització del gen (ratolí)
	Cromosoma: X (ratolí)
Fi	102.526.860 bp
Patró d'expressió d'ARN
	Més explicacions
	tíbia; ; skin of hip ; ; mucosa of ileum ; ; right uterine tube ; ; vulva; ; germinal epithelium ; ; pericardi; ; epithelium of lactiferous gland ; ; conducte galactòfor ; ; left ovary ;
	Més explicacions
	epithelium of lens ; ; corpuscle renal; ; derma; ; neural layer of retina ; ; fossa; ; utricle; ; còndil; ; gastrula ; ; sexually immature organism ; ; músculs intercostals;
	Més referències a dades d'expressió
Ortòlegs
	7503
	213742
	ENSG00000229807
	ENSMUSG00000086503
	Wikidata
Veure/Editar gen humà	Veure/Editar gen del ratolí

Xist (X-inactive specific transcript, traduïble per transcripció específica X-inactiva) és un ARN no codificant transcrit a partir del cromosoma X dels mamífers placentaris que actua com a principal efector del procés d'inactivació X.^[5] És un component del Xic – centre d'inactivació del cromosoma X^[6] – juntament amb dos altres gens d'ARN (Jpx i Ftx) i dos gens de proteïnes (Tsx i Cnbp2).^[7]

L'ARN Xist, és una transcripció gran (17 kb en humans),^[8] i s'expressa al cromosoma inactiu i no a l'actiu. Es processa de manera similar als ARNm, mitjançant empalmament i poliadenilació. Tanmateix, segueix sent sense traduir. S'ha suggerit que aquest gen d'ARN va evolucionar almenys en part a partir d'un gen codificador de proteïnes que es va convertir en un pseudogen.^[9] El cromosoma X inactiu està recobert amb aquesta transcripció, que és essencial per a la inactivació.^[10] Els cromosomes X sense Xist no s'inactivaran, mentre que la duplicació del gen Xist en un altre cromosoma provoca la inactivació d'aquest cromosoma.^[11]

El gen Xist humà va ser descobert per Andrea Ballabio mitjançant un cribratge de la biblioteca d'ADNc i després es va caracteritzar en col·laboració amb Carolyn J. Brown i Hunt Willard.^[12]^[13]

Referències

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000229807 - Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000086503 – Ensembl, May 2017
↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ «Entrez Gene: XIST X (inactive)-specific transcript».
↑ «Silencing of the mammalian X chromosome». Annual Review of Genomics and Human Genetics, 6, 2005, p. 69–92. DOI: 10.1146/annurev.genom.6.080604.162350. PMID: 16124854.
↑ «Comparative sequence analysis of the X-inactivation center region in mouse, human, and bovine». Genome Research, 12, 6, 6-2002, p. 894–908. DOI: 10.1101/gr.152902. PMC: 1383731. PMID: 12045143.
↑ «The human XIST gene: analysis of a 17 kb inactive X-specific RNA that contains conserved repeats and is highly localized within the nucleus». Cell, 71, 3, 10-1992, p. 527–42. DOI: 10.1016/0092-8674(92)90520-M. PMID: 1423611.
↑ «The Xist RNA gene evolved in eutherians by pseudogenization of a protein-coding gene». Science, 312, 5780, 6-2006, p. 1653–1655. Bibcode: 2006Sci...312.1653D. DOI: 10.1126/science.1126316. PMID: 16778056.
↑ «Xist and the order of silencing» (Review Article). EMBO Reports, 8, 1, 1-2007, p. 34–39. DOI: 10.1038/sj.embor.7400871. PMC: 1796754. PMID: 17203100. «Figure 1 Xist RNA encompasses the X from which it is transcribed.»
↑ «Requirement for Xist in X chromosome inactivation». Nature, 379, 6561, 1996, p. 131–7. Bibcode: 1996Natur.379..131P. DOI: 10.1038/379131a0. PMID: 8538762.
↑ «A gene from the region of the human X inactivation centre is expressed exclusively from the inactive X chromosome». Nature, 349, 6304, 1-1991, p. 38–44. Bibcode: 1991Natur.349...38B. DOI: 10.1038/349038a0. PMID: 1985261.
↑ «Gracefully ageing at 50, X-chromosome inactivation becomes a paradigm for RNA and chromatin control». Nature Reviews Molecular Cell Biology, 12, 12, 2011, p. 815–26. DOI: 10.1038/nrm3231. PMID: 22108600.

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000229807 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000086503 – Ensembl, May 2017

[3] «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez_7503-5] «Entrez Gene: XIST X (inactive)-specific transcript».

[6] «Silencing of the mammalian X chromosome». Annual Review of Genomics and Human Genetics, 6, 2005, p. 69–92. DOI: 10.1146/annurev.genom.6.080604.162350. PMID: 16124854.

[7] «Comparative sequence analysis of the X-inactivation center region in mouse, human, and bovine». Genome Research, 12, 6, 6-2002, p. 894–908. DOI: 10.1101/gr.152902. PMC: 1383731. PMID: 12045143.

[pmid1423611-8] «The human XIST gene: analysis of a 17 kb inactive X-specific RNA that contains conserved repeats and is highly localized within the nucleus». Cell, 71, 3, 10-1992, p. 527–42. DOI: 10.1016/0092-8674(92)90520-M. PMID: 1423611.

[Dur09-9] «The Xist RNA gene evolved in eutherians by pseudogenization of a protein-coding gene». Science, 312, 5780, 6-2006, p. 1653–1655. Bibcode: 2006Sci...312.1653D. DOI: 10.1126/science.1126316. PMID: 16778056.

[10] «Xist and the order of silencing» (Review Article). EMBO Reports, 8, 1, 1-2007, p. 34–39. DOI: 10.1038/sj.embor.7400871. PMC: 1796754. PMID: 17203100. «Figure 1 Xist RNA encompasses the X from which it is transcribed.»

[11] «Requirement for Xist in X chromosome inactivation». Nature, 379, 6561, 1996, p. 131–7. Bibcode: 1996Natur.379..131P. DOI: 10.1038/379131a0. PMID: 8538762.

[Brown_1991-12] «A gene from the region of the human X inactivation centre is expressed exclusively from the inactive X chromosome». Nature, 349, 6304, 1-1991, p. 38–44. Bibcode: 1991Natur.349...38B. DOI: 10.1038/349038a0. PMID: 1985261.

[Lee_2011-13] «Gracefully ageing at 50, X-chromosome inactivation becomes a paradigm for RNA and chromatin control». Nature Reviews Molecular Cell Biology, 12, 12, 2011, p. 815–26. DOI: 10.1038/nrm3231. PMID: 22108600.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]