LY6E

LY6E
LY6E
Идентификаторы
Псевдонимы	LY6E, RIG-E, RIGE, SCA-2, SCA2, TSA-1, lymphocyte antigen 6 complex, locus E, lymphocyte antigen 6 family member E
Внешние ID	OMIM: 601384 MGI: 106651 HomoloGene: 56411 GeneCards: LY6E
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	8-я хромосома человека
Конец	143,023,832 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	15-я хромосома мыши
Конец	74,831,754 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	right lobe of liver; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; stromal cell of endometrium; ; upper lobe of left lung; ; hippocampus proper;
	Наибольшая экспрессия в
	lactiferous gland; ; superior surface of tongue; ; cardiac muscles; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; CA3 field;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	acetylcholine receptor inhibitor activity;
Компонент клетки	часть клеточной мембраны; мембрана; anchored component of membrane; внеклеточная область; клеточная мембрана;
Биологический процесс	cell surface receptor signaling pathway; negative regulation of signaling receptor activity;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	4061
	17069
	ENSG00000278032; ENSG00000160932
	ENSMUSG00000022587
	Q16553
	Q64253
	NM_002346; NM_001127213
NM_001164036; NM_001164037; NM_001164038; NM_001164039; NM_001164040;
	NM_008529; NM_001374138
	NP_001120685; NP_002337
NP_001157508; NP_001157509; NP_001157510; NP_001157511; NP_001157512;
	NP_032555; NP_001361067
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Лимфоцитарный антиген 6E — белок семейства лимфоцитарных антигенов LY6, GPI-заякоренный на поверхности клеток. Продукт гена LY6E^[5]^[6]^[7].

Функция

Белок играет роль в развитии T-лимфоцитов. Действует как модулятор активности никотиновых ацетилхолиновых рецепторов (nAChR). In vitro максимально ингибирует α₃β₄-содержащие рецепторы.

Высокий уровень экспрессии ассоциирован с плохим прогнозом многих злокачественных опухолей^[8]. Ly6E связан с возникновением резистентности к препаратам.^[9]

Структура

LY6E состоит из 131 аминокислоты, молекулярная масса 13,5 кДа. Содержит 5 дисульфидный связей, один участок N-гликозилирования и участок связывания гликозилфосфатидилинозитола (GPI), который связывает белок с клеточной мембраной.

Тканевая локализация

Экспрессирован во многих тканях, наиболее высокий уровень экспрессии обнаружен в печени, почках, яичниках, селезёнке и лейкоцитах периферической крови.

Взаимодействия

Взаимодействует с α4-субъединицей nAChR CHRNA4 (nAChRα4).

Примечания

1 2 3 ENSG00000160932 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278032, ENSG00000160932 - Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022587 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Capone M.C., Gorman D.M., Ching E.P., Zlotnik A. Identification through bioinformatics of cDNAs encoding human thymic shared Ag-1/stem cell Ag-2. A new member of the human Ly-6 family (англ.) // J Immunol : journal. — 1996. — September (vol. 157, no. 3). — P. 969—973. — PMID 8757598.
↑ Mao M., Yu M., Tong J.H., Ye J., Zhu J., Huang Q.H., Fu G., Yu L., Zhao S.Y., Waxman S., Lanotte M., Wang Z.Y., Tan J.Z., Chan S.J., Chen Z. RIG-E, a human homolog of the murine Ly-6 family, is induced by retinoic acid during the differentiation of acute promyelocytic leukemia cell (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — July (vol. 93, no. 12). — P. 5910—5914. — doi:10.1073/pnas.93.12.5910. — PMID 8650192. — PMC 39161.
↑ Entrez Gene: LY6E lymphocyte antigen 6 complex, locus E . Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ Luo, Linlin; McGarvey, Peter; Madhavan, Subha; Kumar, Rakesh; Gusev, Yuriy; Upadhyay, Geeta. Distinct lymphocyte antigens 6 (Ly6) family members Ly6D, Ly6E, Ly6K and Ly6H drive tumorigenesis and clinical outcome (англ.) // Oncotarget^[англ.] : journal. — 2016. — 3 February (vol. 7). — P. 11165—11193. — ISSN 1949-2553. — doi:10.18632/oncotarget.7163. — PMID 26862846. — PMC 4905465.
↑ Hossiny, Midrar A.; Luo, Linlin; Frazier, William R.; Steiner, Noriko; Gusev, Yuriy; Kallakury, Bhaskar; Glasgow, Eric; Creswell, Karen; Madhavan, Subha; Kumar, Rakesh; Upadhyay, Geeta. Ly6E/K signaling to TGF-ß promotes breast cancer progression, immune escape and drug resistance (англ.) // Cancer Research : journal. — American Association for Cancer Research^[англ.], 2016. — 11 April (vol. 76). — P. canres.2654.2015. — ISSN 0008-5472. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-15-2654. Архивировано 15 апреля 2019 года.

Литература

Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
Brakenhoff R.H., van Dijk M., Rood-Knippels E.M., Snow G.B. A gain of novel tissue specificity in the human Ly-6 gene E48 (англ.) // J. Immunol. : journal. — 1997. — Vol. 159, no. 10. — P. 4879—4886. — PMID 9366413.
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
Shan X., Bourdeau A., Rhoton A., Wells D.E., Cohen E.H., Landgraf B.E., Palfree R.G. Characterization and mapping to human chromosome 8q24.3 of Ly-6-related gene 9804 encoding an apparent homologue of mouse TSA-1 (англ.) // J. Immunol. : journal. — 1998. — Vol. 160, no. 1. — P. 197—208. — PMID 9551972.
Kosugi A., Saitoh S., Noda S., Miyake K., Yamashita Y., Kimoto M., Ogata M., Hamaoka T. Physical and functional association between thymic shared antigen-1/stem cell antigen-2 and the T cell receptor complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 20. — P. 12301—12306. — doi:10.1074/jbc.273.20.12301. — PMID 9575182.
Ding L., Shevach E.M. Inhibition of the function of the FcγRIIB by a monoclonal antibody to thymic shared antigen-1, a Ly-6 family antigen (англ.) // Immunology : journal. — 2001. — Vol. 104, no. 1. — P. 28—36. — doi:10.1046/j.1365-2567.2001.01275.x. — PMID 11576217. — PMC 1783287.
Zammit D.J., Berzins S.P., Gill J.W., Randle-Barrett E.S., Barnett L., Koentgen F., Lambert G.W., Harvey R.P., Boyd R.L., Classon B.J. Essential Role for the Lymphostromal Plasma Membrane Ly-6 Superfamily Molecule Thymic Shared Antigen 1 in Development of the Embryonic Adrenal Gland (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 3. — P. 946—952. — doi:10.1128/MCB.22.3.946-952.2002. — PMID 11784869. — PMC 133557.
de Nooij-van Dalen A.G., van Dongen G.A., Smeets S.J., Nieuwenhuis E.J., Stigter-van Walsum M., Snow G.B., Brakenhoff R.H. Characterization of the human Ly-6 antigens, the newly annotated member Ly-6K included, as molecular markers for head-and-neck squamous cell carcinoma (англ.) // Int. J. Cancer^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 103, no. 6. — P. 768—774. — doi:10.1002/ijc.10903. — PMID 12516096.

[refGRCh38EnsemblENSG00000278032,_ENSG00000160932-1] 1 2 3 ENSG00000160932 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278032, ENSG00000160932 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000022587-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022587 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8757598-5] Capone M.C., Gorman D.M., Ching E.P., Zlotnik A. Identification through bioinformatics of cDNAs encoding human thymic shared Ag-1/stem cell Ag-2. A new member of the human Ly-6 family (англ.) // J Immunol : journal. — 1996. — September (vol. 157, no. 3). — P. 969—973. — PMID 8757598.

[pmid8650192-6] Mao M., Yu M., Tong J.H., Ye J., Zhu J., Huang Q.H., Fu G., Yu L., Zhao S.Y., Waxman S., Lanotte M., Wang Z.Y., Tan J.Z., Chan S.J., Chen Z. RIG-E, a human homolog of the murine Ly-6 family, is induced by retinoic acid during the differentiation of acute promyelocytic leukemia cell (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — July (vol. 93, no. 12). — P. 5910—5914. — doi:10.1073/pnas.93.12.5910. — PMID 8650192. — PMC 39161.

[entrez-7] Entrez Gene: LY6E lymphocyte antigen 6 complex, locus E . Архивировано 5 декабря 2010 года.

[8] Luo, Linlin; McGarvey, Peter; Madhavan, Subha; Kumar, Rakesh; Gusev, Yuriy; Upadhyay, Geeta. Distinct lymphocyte antigens 6 (Ly6) family members Ly6D, Ly6E, Ly6K and Ly6H drive tumorigenesis and clinical outcome (англ.) // Oncotarget^[англ.] : journal. — 2016. — 3 February (vol. 7). — P. 11165—11193. — ISSN 1949-2553. — doi:10.18632/oncotarget.7163. — PMID 26862846. — PMC 4905465.

[9] Hossiny, Midrar A.; Luo, Linlin; Frazier, William R.; Steiner, Noriko; Gusev, Yuriy; Kallakury, Bhaskar; Glasgow, Eric; Creswell, Karen; Madhavan, Subha; Kumar, Rakesh; Upadhyay, Geeta. Ly6E/K signaling to TGF-ß promotes breast cancer progression, immune escape and drug resistance (англ.) // Cancer Research : journal. — American Association for Cancer Research^[англ.], 2016. — 11 April (vol. 76). — P. canres.2654.2015. — ISSN 0008-5472. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-15-2654. Архивировано 15 апреля 2019 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]