UROD

UROD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JPH, 1JPI, 1JPK, 1R3Q, 1R3R, 1R3S, 1R3T, 1R3V, 1R3W, 1R3Y, 1URO, 2Q6Z, 2Q71, 3GVQ, 3GVR, 3GVV, 3GVW, 3GW0, 3GW3
Ідентифікатори
Символи	UROD, PCT, UPD, uroporphyrinogen decarboxylase
Зовнішні ІД	OMIM: 613521 MGI: 98916 HomoloGene: 320 GeneCards: UROD
шифр КФ	4.1.1.37
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • ліазна активність • uroporphyrinogen decarboxylase activity • carboxy-lyase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • protoporphyrinogen IX biosynthetic process • porphyrin-containing compound biosynthetic process • heme biosynthetic process • heme metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7389	22275
Ensembl	ENSG00000126088	ENSMUSG00000028684
UniProt	P06132	P70697
RefSeq (мРНК)	NM_000374	NM_009478
RefSeq (білок)	NP_000365	NP_033504
Локус (UCSC)	Хр. 1: 45.01 – 45.02 Mb	Хр. 4: 116.85 – 116.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UROD (англ. Uroporphyrinogen decarboxylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 367 амінокислот, а молекулярна маса — 40 787.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEANGLGPQG		FPELKNDTFL		RAAWGEETDY		TPVWCMRQAG		RYLPEFRETR
AAQDFFSTCR		SPEACCELTL		QPLRRFPLDA		AIIFSDILVV		PQALGMEVTM
VPGKGPSFPE		PLREEQDLER		LRDPEVVASE		LGYVFQAITL		TRQRLAGRVP
LIGFAGAPWT		LMTYMVEGGG		SSTMAQAKRW		LYQRPQASHQ		LLRILTDALV
PYLVGQVVAG		AQALQLFESH		AGHLGPQLFN		KFALPYIRDV		AKQVKARLRE
AGLAPVPMII		FAKDGHFALE		ELAQAGYEVV		GLDWTVAPKK		ARECVGKTVT
LQGNLDPCAL		YASEEEIGQL		VKQMLDDFGP		HRYIANLGHG		LYPDMDPEHV
GAFVDAVHKH		SRLLRQN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Phillips J.D., Whitby F.G., Kushner J.P., Hill C.P. (1997). Characterization and crystallization of human uroporphyrinogen decarboxylase. Protein Sci. 6: 1343—1346. PMID 9194196 doi:10.1002/pro.5560060624
• Whitby F.G., Phillips J.D., Kushner J.P., Hill C.P. (1998). Crystal structure of human uroporphyrinogen decarboxylase. EMBO J. 17: 2463—2471. PMID 9564029 doi:10.1093/emboj/17.9.2463
• Phillips J.D., Whitby F.G., Kushner J.P., Hill C.P. (2003). Structural basis for tetrapyrrole coordination by uroporphyrinogen decarboxylase. EMBO J. 22: 6225—6233. PMID 14633982 doi:10.1093/emboj/cdg606
• de Verneuil H., Grandchamp B., Beaumont C., Picat C., Nordmann Y. (1986). Uroporphyrinogen decarboxylase structural mutant (Gly-281-->Glu) in a case of porphyria. Science. 234: 732—734. PMID 3775362 doi:10.1126/science.3775362
• McManus J.F., Begley C.G., Sassa S., Ratnaike S. (1999). Three new mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase gene in familial porphyria cutanea tarda. Hum. Mutat. 13: 412—412. PMID 10338097 doi:10.1002/(SICI)1098-1004(1999)13:5<412::AID-HUMU11>3.3.CO;2-K

Див. також

• Хромосома 1