BCAM

BCAM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PET, 2PF6
Ідентифікатори
Символи	BCAM, AU, CD239, LU, MSK19, basal cell adhesion molecule (Lutheran blood group)
Зовнішні ІД	OMIM: 612773 MGI: 1929940 HomoloGene: 21149 GeneCards: BCAM
Онтологія гена Молекулярна функція • laminin receptor activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • laminin binding • активність трансмембранного сигнального рецептора Клітинна компонента • інтегральний компонент мембрани • поверхня клітини • клітинна мембрана • інтегральний компонент плазматичної мембрани • екзосома • мембрана • зовнішня поверхня плазматичної мембрани • GO:0005578 позаклітинний матрикс • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • адгезія клітин • cell-matrix adhesion • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4059	57278
Ensembl	ENSG00000187244	ENSMUSG00000002980
UniProt	P50895	Q9R069
RefSeq (мРНК)	NM_005581 NM_001013257	NM_020486
RefSeq (білок)	NP_001013275 NP_005572	NP_065232
Локус (UCSC)	Хр. 19: 44.81 – 44.82 Mb	Хр. 7: 19.49 – 19.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BCAM (англ. Basal cell adhesion molecule (Lutheran blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 628 амінокислот, а молекулярна маса — 67 405.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPPDAPAQA		RGAPRLLLLA		VLLAAHPDAQ		AEVRLSVPPL		VEVMRGKSVI
LDCTPTGTHD		HYMLEWFLTD		RSGARPRLAS		AEMQGSELQV		TMHDTRGRSP
PYQLDSQGRL		VLAEAQVGDE		RDYVCVVRAG		AAGTAEATAR		LNVFAKPEAT
EVSPNKGTLS		VMEDSAQEIA		TCNSRNGNPA		PKITWYRNGQ		RLEVPVEMNP
EGYMTSRTVR		EASGLLSLTS		TLYLRLRKDD		RDASFHCAAH		YSLPEGRHGR
LDSPTFHLTL		HYPTEHVQFW		VGSPSTPAGW		VREGDTVQLL		CRGDGSPSPE
YTLFRLQDEQ		EEVLNVNLEG		NLTLEGVTRG		QSGTYGCRVE		DYDAADDVQL
SKTLELRVAY		LDPLELSEGK		VLSLPLNSSA		VVNCSVHGLP		TPALRWTKDS
TPLGDGPMLS		LSSITFDSNG		TYVCEASLPT		VPVLSRTQNF		TLLVQGSPEL
KTAEIEPKAD		GSWREGDEVT		LICSARGHPD		PKLSWSQLGG		SPAEPIPGRQ
GWVSSSLTLK		VTSALSRDGI		SCEASNPHGN		KRHVFHFGTV		SPQTSQAGVA
VMAVAVSVGL		LLLVVAVFYC		VRRKGGPCCR		QRREKGAPPP		GEPGLSHSGS
EQPEQTGLLM		GGASGGARGG		SGGFGDEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 doi:10.1038/nbt827

Див. також

• Хромосома 19