GATA5

GATA5
Ідентифікатори
Символи	GATA5, GATAS, bB379O24.1, GATA binding protein 5, CHTD5
Зовнішні ІД	OMIM: 611496 MGI: 109497 HomoloGene: 32031 GeneCards: GATA5
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з ДНК • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іонами цинку • chromatin binding • зв’язування з іоном металу • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми Клітинна компонента • регуляторний транскрипційний комплекс • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to BMP stimulus • зсідання крові • ДНК-матрична транскрипція • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • intestinal epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • aortic valve morphogenesis • endocardial cushion fusion • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction • positive regulation of cardiac endothelial to mesenchymal transition • development of the heart • animal organ morphogenesis • гістогенез • розвиток клітин • anatomical structure formation involved in morphogenesis • digestive tract development • cardiac muscle tissue development • circulatory system development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140628	14464
Ensembl	ENSG00000130700	ENSMUSG00000015627
UniProt	Q9BWX5	P97489
RefSeq (мРНК)	NM_080473	NM_008093
RefSeq (білок)	NP_536721	NP_032119
Локус (UCSC)	Хр. 20: 62.46 – 62.48 Mb	Хр. 2: 179.97 – 179.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GATA5 (англ. GATA binding protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 41 299.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYQSLALAAS		PRQAAYADSG		SFLHAPGAGS		PMFVPPARVP		SMLSYLSGCE
PSPQPPELAA		RPGWAQTATA		DSSAFGPGSP		HPPAAHPPGA		TAFPFAHSPS
GPGSGGSAGG		RDGSAYQGAL		LPREQFAAPL		GRPVGTSYSA		TYPAYVSPDV
AQSWTAGPFD		GSVLHGLPGR		RPTFVSDFLE		EFPGEGRECV		NCGALSTPLW
RRDGTGHYLC		NACGLYHKMN		GVNRPLVRPQ		KRLSSSRRAG		LCCTNCHTTN
TTLWRRNSEG		EPVCNACGLY		MKLHGVPRPL		AMKKESIQTR		KRKPKTIAKA
RGSSGSTRNA		SASPSAVAST		DSSAATSKAK		PSLASPVCPG		PSMAPQASGQ
EDDSLAPGHL		EFKFEPEDFA		FPSTAPSPQA		GLRGALRQEA		WCALALA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Gu J.Y., Xu J.H., Yu H., Yang Y.Q. (2012). Novel GATA5 loss-of-function mutations underlie familial atrial fibrillation. Clinics (Sao Paulo). 67: 1393—1399. PMID 23295592 doi:10.6061/clinics/2012(12)08
• Padang R., Bagnall R.D., Richmond D.R., Bannon P.G., Semsarian C. (2012). Rare non-synonymous variations in the transcriptional activation domains of GATA5 in bicuspid aortic valve disease. J. Mol. Cell. Cardiol. 53: 277—281. PMID 22641149 doi:10.1016/j.yjmcc.2012.05.009
• Huang R.T., Xue S., Xu Y.J., Zhou M., Yang Y.Q. (2014). Somatic GATA5 mutations in sporadic tetralogy of Fallot. Int. J. Mol. Med. 33: 1227—1235. PMID 24573614 doi:10.3892/ijmm.2014.1674

Див. також

• Хромосома 20