HHEX

HHEX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E1O
Ідентифікатори
Символи	HHEX, HEX, HMPH, HOX11L-PEN, PRH, PRHX, hematopoietically expressed homeobox
Зовнішні ІД	OMIM: 604420 MGI: 96086 HomoloGene: 31110 GeneCards: HHEX
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • зв'язування з ДНК • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • гомодимеризація білків • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з HMG-боксом • зв'язування з фактором транскрипції • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • eukaryotic initiation factor 4E binding • TBP-class protein binding • DNA binding, bending • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • ДНК-білковий комплекс • клітинне ядро Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • myeloid leukocyte differentiation • endoderm development • DNA conformation change • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • primary lung bud formation • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • multicellular organism growth • embryonic organ development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • interkinetic nuclear migration • negative regulation of transcription by competitive promoter binding • hepatocyte differentiation • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt • tissue morphogenesis • mRNA export from nucleus • ДНК-матрична транскрипція • embryonic heart tube development • васкулогенез • morphogenesis of an epithelium • poly(A)+ mRNA export from nucleus • positive regulation of Wnt signaling pathway • forebrain morphogenesis • розвиток багатоклітинного організму • hepatoblast differentiation • thyroid gland development • common bile duct development • regulation of cell population proliferation • protein localization to nucleus • gall bladder development • negative regulation of angiogenesis • pancreas development • animal organ morphogenesis • B cell differentiation • hepatic duct development • liver development • negative regulation of transcription by transcription factor localization • розвиток переднього мозку • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • primitive streak formation • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • response to peptide hormone • response to wounding • диференціація клітин • кровотворення • regulation of leukocyte proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3087	15242
Ensembl	ENSG00000152804	ENSMUSG00000024986
UniProt	Q03014	P43120
RefSeq (мРНК)	NM_002729	NM_008245
RefSeq (білок)	NP_002720	NP_032271
Локус (UCSC)	Хр. 10: 92.69 – 92.7 Mb	Хр. 19: 37.42 – 37.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HHEX (англ. Hematopoietically expressed homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 30 022.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQYPHPGPAA		GAVGVPLYAP		TPLLQPAHPT		PFYIEDILGR		GPAAPTPAPT
LPSPNSSFTS		LVSPYRTPVY		EPTPIHPAFS		HHSAAALAAA		YGPGGFGGPL
YPFPRTVNDY		THALLRHDPL		GKPLLWSPFL		QRPLHKRKGG		QVRFSNDQTI
ELEKKFETQK		YLSPPERKRL		AKMLQLSERQ		VKTWFQNRRA		KWRRLKQENP
QSNKKEELES		LDSSCDQRQD		LPSEQNKGAS		LDSSQCSPSP		ASQEDLESEI
SEDSDQEVDI		EGDKSYFNAG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hromas R.A., Collins S.J., Radich J. (1993). PCR cloning of an orphan homeobox gene (PRH) preferentially expressed in myeloid and liver cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 195: 976—983. PMID 8103988 doi:10.1006/bbrc.1993.2140
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Bedford F.K., Ashworth A., Enver T., Wiedemann L.M. (1993). HEX: a novel homeobox gene expressed during haematopoiesis and conserved between mouse and human. Nucleic Acids Res. 21: 1245—1249. PMID 8096636 doi:10.1093/nar/21.5.1245
• Neidle S., Goodwin G.H. (1994). A homology-based molecular model of the proline-rich homeodomain protein Prh, from haematopoietic cells. FEBS Lett. 345: 93—98. PMID 7911091 doi:10.1016/0014-5793(94)00446-3

Див. також

• Хромосома 10