HOXA5

HOXA5
Ідентифікатори
Символи	HOXA5, HOX1, HOX1.3, HOX1C, homeobox A5
Зовнішні ІД	OMIM: 142952 MGI: 96177 HomoloGene: 40726 GeneCards: HOXA5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• embryonic skeletal system morphogenesis; • pattern specification process; • skeletal system development; • respiratory system process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • multicellular organism growth; • lung development; • trachea morphogenesis; • bronchiole development; • cell-cell signaling involved in mammary gland development; • regulation of mammary gland epithelial cell proliferation; • mammary gland alveolus development; • lung goblet cell differentiation; • ДНК-матрична транскрипція; • mammary gland epithelial cell differentiation; • negative regulation of erythrocyte differentiation; • respiratory gaseous exchange by respiratory system; • trachea cartilage morphogenesis; • embryonic skeletal system development; • morphogenesis of an epithelium; • розвиток багатоклітинного організму; • thyroid gland development; • lobar bronchus epithelium development; • mesenchymal-epithelial cell signaling; • позитивна регуляція апоптозу; • intestinal epithelial cell maturation; • negative regulation of angiogenesis; • cartilage morphogenesis; • lung alveolus development; • lung-associated mesenchyme development; • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis; • cell migration; • positive regulation of myeloid cell differentiation; • anterior/posterior pattern specification; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3202
	15402
	ENSG00000106004
	ENSMUSG00000038253
	P20719
	P09021
	NM_019102
	NM_010453
	NP_061975
	NP_034583
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXA5 (англ. Homeobox A5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 29 345^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSYFVNSFC	GRYPNGPDYQ	LHNYGDHSSV	SEQFRDSASM	HSGRYGYGYN
GMDLSVGRSG	SGHFGSGERA	RSYAASASAA	PAEPRYSQPA	TSTHSPQPDP
LPCSAVAPSP	GSDSHHGGKN	SLSNSSGASA	DAGSTHISSR	EGVGTASGAE
EDAPASSEQA	SAQSEPSPAP	PAQPQIYPWM	RKLHISHDNI	GGPEGKRART
AYTRYQTLEL	EKEFHFNRYL	TRRRRIEIAH	ALCLSERQIK	IWFQNRRMKW
KKDNKLKSMS	MAAAGGAFRP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Tournier-Lasserve E., Odenwald W.F., Garbern J., Trojanowski J., Lazzarini R.A. (1989). Remarkable intron and exon sequence conservation in human and mouse homeobox Hox 1.3 genes. Mol. Cell. Biol. 9: 2273—2278. PMID 2568583 doi:10.1128/MCB.9.5.2273
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5106 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P20719 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5106 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P20719 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]